Seran los mismos casi seguro. como estan desincronizados?? Me explico.
Si la desincronización es solo que estan varios segundos desfasados antes o despues uniformemente te puedes pillar una utilidad de subtitulos y meterles ese retardo para que essten sincronizados. Tambien puedes meterle ese retardo directamente al codec que uses para ver los subtitulos, pero tendras que hacerlo siempre que la veas.
Ahora viene los problemas.
Si no usas codecs y ves las pelis con subs con el BSPlayer creo que no podras meterle ese retardo y tendras que modificarlos. Bajate el subtitle Workshop y abres los subs, en uno de los menus veras una opcion para meter retardo (delay creo que es) en los subs, puedes meterlo positivo (meter segundos) o negatuvo (quitar segundo). Solo tienes que fijarte en que segundo empiezan a habalr y en cual empiezan los subs y ver cuanto tienes que meter o quitar y ajustar asi. No es dificil.
Bueno, si los subs lo que pasa es qeu empiezan sincronizados y se van desincronizando con el tiempo pues pasa que la pelicula tiene mas o menos frames por segundo (fps) que para los qu eestan hechos los subs. Esto nunca he podido llegar a solucionarlo, por lo menos con el subtitle workshop.
Un saludo.